Tahun 1972, Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia (LIPI) memublikasikan sebanyak 6.127 nama pulau-pulau di Indonesia. Pada tahun 1987 Pusat Survei dan Pemetaan ABRI (Pussurta ABRI) menyatakan bahwa jumlah pulau di Indonesia adalah sebanyak 17.508, di mana 5.707 di antaranya telah memiliki nama, termasuk 337 nama pulau di sungai. Badan Koordinasi Survei dan Pemetaan Nasional (Bakosurtanal), pada tahun 1992 menerbitkan Gazetteer Nama-nama Pulau dan Kepulauan Indonesia yang mencatat sebanyak 6.489 pulau bernama, termasuk 374 nama pulau di sungai. Lembaga Penerbangan dan Antariksa Nasional (Lapan), Pada tahun 2002 berdasarkan hasil kajian citra satelit menyatakan bahwa jumlah pulau di Indonesia adalah sebanyak 18.306 buah.
Data Departemen Dalam Negeri berdasarkan laporan dari para gubernur dan bupati/walikota, pada tahun 2004 menyatakan bahwa 7.870 pulau yang bernama, sedangkan 9.634 pulau tak bernama.
Dari sekian banyaknya pulau-pulau di Indonesia, yang berpenghuni hanya sekitar 6.000 pulau. Di bawah ini disajikan pulau-pulau utama Indonesia:
Sumatera
Aceh
Pulau Babi
Pulau Bangkaru
Pulau Breueh
Pulau Kayee
Pulau Lasia
Pulau Nasi
Pulau Panyang
Pulau Pasi
Pulau Peunasue
Pulau Penasi
Pulau Raya
Pulau Reusam
Pulau Rondo
Pulau Rusa
Pulau Salaut Besar
Pulau Sembilan
Pulau Sembilan
Pulau Seumut
Pulau Simeulue
Pulau Simeuleu ceut
Pulau Tapah
Pulau Trumon
Pulau Tuangku
Pulau Tulo
Pulau Weh
Kepulauan Bangka Belitung
Pulau Aur
Pulau Babi, Bangka Belitung
Pulau Bakau
Pulau Bangka
Pulau Belitung
Pulau Gersik
Pulau Kalangbau
Pulau Kelemar
Pulau Kuil
Pulau Lepar
Pulau Nasik
Pulau Panjang
Pulau Pongok
Pulau Semujur
Pulau Tujuh
pulau nangka
pulau ketawai
pulau gusung asam
pulau mendanau
pulau memperak
pulau buku limau
pulau nado
pulau lengkuas
Bengkulu
Pulau Enggano
Pulau Mega
Jambi
Lampung
Pulau Anak Krakatau
Pulau Batu Kecil
Pulau Legundi
Pulau Panjang
Pulau Pasaran
Pulau Rakata
Pulau Rakata Kecil
Pulau Sebesi
Pulau Sebuku
Pulau Sertung
Pulau Tabuan
Riau
Pulau Bengkalis
Pulau Kundur
Pulau Padang
Pulau Rangsang
Pulau Rupat
Pulau Jemur
Kepulauan Riau
Kepulauan Anambas
Kepulauan Badas
Kepulauan Karimun
Kepulauan Lingga
Kepulauan Natuna
Kepulauan Natuna Besar
Kepulauan Natuna Selatan
Kepulauan Riau
Kepulauan Tambelan
Pulau Abang
Pulau Abang Besar
Pulau Bakong atau Pulau Bakung
Pulau Batam
Pulau Batang
Pulau Batu Berhanti
Pulau Belat
Pulau Benuwa atau Pulau Benua
Pulau Bintan
Pulau Buaya
Pulau Bugi
Pulau Bulan
Pulau Bunguran
Pulau Buru
Pulau Damar
Pulau Combol
Pulau Dompak
Pulau Galang
Pulau Iyu Kecil
Pulau Jemaja
Pulau Karimun
Pulau Karimun Kecil atau Pulau Anak Karimun
Pulau Kelapa Jernih
Pulau Kepala
Pulau Kundur
Pulau Lagong
Pulau Lalang
Pulau Laut
Pulau Lingga
Pulau Mangkai
Pulau Mapor
Pulau Matak
Pulau Mendarik
Pulau Mesawak
Pulau Midai
Pulau Mubur
Pulau Murih
Pulau Nanas
Pulau Nipa atau Pulau Nipah
Pulau Nongsa
Pulau Panjang
Pulau Papan
Pulau Parit
Pulau Pejantan
Pulau Pelampong
Pulau Pengibu
Pulau Penyengat
Pulau Pinang Seribu
Pulau Posik
Pulau Raiba
Pulau Rempang
Pulau Sambu
Pulau Sebangka
Pulau Sebetul
Pulau Sekatung
Pulau Selayar
Pulau Semiun
Pulau Sentut
Pulau Senua
Pulau Serak
Pulau Serasa
Pulau Singkep
Pulau Subi
Pulau Subi Kecil
Pulau Tambelan Besar
Pulau Tarempa atau Pulau Tarempah
Pulau Temiyang atau Pulau Temiang
Pulau Timau
Pulau Tokong Belayar
Pulau Tokong Iyu
Pulau Tokong Malang Biru
Pulau Tokong Nanas
Pulau Tokong Piramida
Pulau Tokongboro
Pulau Uwi
Sumatera Utara
Pulau Bojo
Kepulauan Hinako
Pulau Musala
Pulau Nias
Pulau Pangururan
Pulau Pini
Pulau Tanabala
Pulau Tanahmasa
Pulau Telo
Pulau Samosir
Pulau Berhala
Pulau Pandang
Pulau Salahnama
Sumatera Selatan
Sumatera Barat
Pulau Karangmanjat
Pulau Masokut
Pulau Pagai Selatan
Pulau Pagai Utara
Pulau Sandin
Pulau Siberut
Pulau Siduamata
Pulau Tinopo
Maluku
Pulau Ambelau
Pulau Ambon
Pulau Boana
Pulau Buru
Pulau Damar
Pulau Geser
Pulau Haruk
Kepulauan Babar
Pulau Babar
Pulau Dai
Pulau Marsela
Pulau Wetan
Kepulauan Kai
Pulau Kai Besar
Pulau Kai Kecil
Kepulauan Aru
Pulau Enu
Pulau Jin
Pulau Kobror
Pulau Kola
Pulau Maikoor
Pulau Penambulan
Pulau Penjuring
Pulau Ujir
Kepulauan Leti
Pulau Lakor
Pulau Leti
Pulau Moa
Kepulauan Tanimbar
Pulau Fordate
Pulau Larat
Pulau Molu
Pulau Nuswotar
Pulau Selaru
Pulau Selur
Pulau Sera
Pulau Wuliaru
Pulau Yamdena
Kepulauan Seram laut
Pulau Gorong
Pulau Manawoka
Pulau Panjang
Kepulauan Sermata
Pulau Kapala
Pulau Luang
Pulau Sermata
Kepulauan Tayandu
Pulau Kaimeer
Pulau Kur
Pulau Walir
Kepulauan Watubela
Pulau Kasiui
Pulau Tioor
Pulau Kisar
Pulau Liran
Pulau Manipa
Pulau Manuk
Pulau Moaror
Pulau Panjang
Pulau Romang
Pulau Seram
Pulau Serua
Pulau Terbang Selatan
Pulau Terbang Utara
Pulau Safa Renyut
Maluku Utara
Kepulauan Aru
Pulau Bisa
Kepulauan Babar
Pulau Bacan
Pulau Dagasuli
Pulau Dai
Pulau Damar
Pulau Failonga
Pulau Gebe
Pulau Halmahera
Pulau Hasil
Pulau Inggelang
Pulau Jarongan
Pulau Kahatola
Pulau Kasiruta
Pulau Kayoa
Kepulauan Leti
Pulau Lifamatola
Pulau Makian
Pulau Malamala
Pulau Mandioli
Pulau Mangole
Pulau Mare
Pulau Moti
Pulau Morotai
Pulau Muar
Pulau Muara
Kepulauan Obi
Pulau Obilatu
Pulau Pisang
Pulau Sanana
Pulau Saparua
Pulau Sayafi
Pulau Seram
Kepulauan Sula
Pulau Taliabo
Pulau Tanet
Kepulauan Tanimbar
Pulau Tapat
Pulau Ternate
Pulau Tidore
Pulau Tubalai
Pulau Uta
Pulau Wetar
Jawa
Jawa Tengah
Kepulauan Karimunjawa(Kabupaten Jepara)
Pulau Karimunjawa
Pulau Kemujan
Pulau Parang
Pulau Nyamuk
Pulau Genting
Pulau Bengkoang
Pulau Geleang
Pulau Kembar
Pulau Kumbang
Pulau Katang
Pulau Krakal Kecil
Pulau Krakal Besar
Pulau Menjangan Besar
Pulau Menjangan Kecil
Pulau Cemara Besar
Pulau Cemara Kecil
Pulau Burung
Pulau Sintok
Pulau Mrican
Pulau Tengah
Pulau Pinggir
Pulau Cilik
Pulau Gundul
Pulau Seruni
Pulau Tambangan
Pulau Cendekian
Pulau Mencawakan atau Pulau Menyawakan
Pulau Mondoliko, (Kabupaten Jepara)
Pulau Marongan, (Kabupaten Rembang)
Pulau Gede, (Kabupaten Rembang)
Pulau Karang Gosong, (Kabupaten Rembang)
Pulau Karang Bapang, (Kabupaten Batang)
Pulau Nusa Kambangan, (Kabupaten Cilacap)
Jawa Timur
Pulau Bawean, (Kabupaten Gresik)
Pulau Iyang
Pulau Madura, (Jawa Timur)
Pulau Masalembu
Pulau Puteri
Pulau Raas
Pulau Raja
Pulau Sapudi
Kepulauan Kangean (Kabupaten Sumenep)
Pulau Kangean
Pulau Paliat
Pulau Sabunting
Pulau Sapanjang
Pulau Saubi
Jawa Barat
Pulau Manuk, (Jawa Barat)
Kepulauan Biawak, (Kabupaten Indramayu, Jawa Barat)
Pulau Biawak
Pulau Rakit
Pulau Candikian
Pulau Gosong
DKI Jakarta
Kepulauan Seribu
Pulau Kahyangan
Pulau Pabelokan
Pulau Bidadari
Pulau Onrust
Pulau Edam
Pulau Kelor
Pulau Rambut
Pulau Ayer
Pulau Puteri
Pulau Matahari
Pulau Sepa
Pulau Pantara Barat dan Pulau Pantara Timur
Pulau Bira Besar
Pulau Kotok
Pulau Pelangi
Pulau Papa Theo
Pulau Laki
Pulau Pamagaran
Pulau Sabira
Pulau Saktu dan Pulau Penike
Pulau Kotok
Pulau Papa Theo
Pulau Peniki
Pulau Matahari
Pulau Gosonglaga
Pulau Sepa
Pulau Kelapa
Pulau Harapan
Pulau Untung Jawa
Pulau Tidung
Pulau Pari
Pulau Panggang
Banten
Pulau Panjang
Pulau Sangiang
Pulau Cangkir
Pulau Pamujan Kecil
Pulau Pamujan Besar
Pulau Kubur
Pulau Kamanisan
Pulau Tanjungbaju
Pulau Kali
Pulau Salira
Pulau Merak atau Pulau Merak Besar
Pulau Merak Kecil
Pulau Panaitan
Pulau Peucang
Pulau Handeuleum
Pulau Tampurung
Daerah Istimewa Yogyakarta
Nusa Tenggara
Bali
Pulau Bali 8°20′00″S 115°00′00″E / 8.33333333333°LS 115°BT
Pulau Batulumbung 8°48′11″S 115°31′40″E / 8.80305555556°LS 115.527777778°BT
Nusa Besar 8°44′00″S 115°32′00″E / 8.73333333333°LS 115.533333333°BT
Gili Biaha 8°31′00″S 115°37′00″E / 8.51666666667°LS 115.616666667°BT
The Brothers 8°48′00″S 115°14′00″E / 8.8°LS 115.233333333°BT
Nusa Ceningan 8°42′S 115°27′E / 8.7°LS 115.45°BT
Nusa Lembaogan 8°41′00″S 115°27′00″E / 8.68333333333°LS 115.45°BT
Pulau Nusadua 8°48′00″S 115°14′30″E / 8.8°LS 115.241666667°BT
Pulau Nusa Penida 8°44′00″S 115°32′00″E / 8.7333°LS 115.5333°BT
Pulau Serangan 8°44′00″S 115°14′00″E / 8.73333333333°LS 115.233333333°BT
Gili Tepekong 8°34′00″S 115°35′00″E / 8.56666666667°LS 115.583333333°BT
Nusa Tenggara Barat
Pulau Burung 8°26′20″S 117°02′20″E / 8.43888888889°LS 117.038888889°BT
Pulau Dangar-besar 8°26′00″S 117°40′00″E / 8.43333333333°LS 117.666666667°BT
Pulau Dompo 8°35′00″S 117°50′00″E / 8.58333333333°LS 117.833333333°BT
Pulau Ganteng 8°36′00″S 117°50′00″E / 8.6°LS 117.833333333°BT
Pulau Giri Banta
Pulau Kelapa
Pulau Liong atau Pulau Liang 8°30′00″S 117°40′00″E / 8.5°LS 117.666666667°BT
Pulau Lombok
Pulau Medang
Pulau Moyo atau Pulau Mojo 8°15′00″S 117°34′00″E / 8.25°LS 117.566666667°BT
Pulau Ngali 8°32′00″S 117°44′00″E / 8.53333333333°LS 117.733333333°BT
Pulau Panjang
Pulau Pelandan
Pulau Rakit atau Pulau Raki 8°39′00″S 117°59′00″E / 8.65°LS 117.983333333°BT
Pulau Sangeang
Pulau Satonda
Pulau Sumbawa
Pulau Tengar 8°34′00″S 117°46′00″E / 8.56666666667°LS 117.766666667°BT
Taikabo 8°37′00″S 117°52′00″E / 8.61666666667°LS 117.866666667°BT
Nusa Tenggara Timur
Pulau Adonara
Pulau Alor
Pulau Babi, Flores
Pulau Besar
Pulau Bidadari (Labuan Bajo, Nusa Tenggara Timur)
Pulau Ende
Pulau Flores
Pulau Komodo
Pulau Lombien (Pulau Lembata)
Pulau Mules
Pulau Ndana
Pulau Pakse
Pulau Palue
Pulau Pamana
Pulau Pamana Besar
Pulau Pantar
Pulau Rinca
Pulau Rote
Pulau Semua
Pulau Sawu
Pulau Solor
Pulau Sumba
Pulau Timor
Kalimantan
Kalimantan Barat
Pulau Buwan
Pulau Gelam
Pulau Panembangan
Pulau Pelapis
Pulau Pengki
Kepulauan Karimata
Pulau Karimata
Pulau Serutu
Pulau Surunggading
Pulau Bulu
Pulau Lemukutan
Pulau Teluk Air
Pulau Temaju
Kalimantan Selatan
Pulau Jatisari
Pulau Kadapang
Pulau Kalambau
Pulau Karamaian
Pulau Laut
Pulau Moresa
Pulau Sebuku
Pulau Sakambing
Pulau Kembang
Kalimantan Tengah
Kalimantan Timur
Pulau Bilang-bilangan
Pulau Bunyu
Pulau Derawan
Pulau Kakaban
Pulau Nunukan
Pulau Panjang
Pulau Sabakkatan
Pulau Sangalaki
Pulau Sebatik
Pulau Semama
Pulau Tarakan
Pulau Tanjung Buaya
Pulau Terentang
Sulawesi
Gorontalo
Pulau Otangale
Sulawesi Barat
Sulawesi Selatan
Pulau Bonerate
Pulau Kalao
Pulau Kalaotoa
Pulau Kayuadi
Pulau Pasi
Pulau Selayar
Pulau Tanah Jampea
Pulau Tanakeke
Sulawesi Tengah
Kepulauan Banggai
Pulau Banggai
Pulau Bengkulu
Pulau Labobo
Pulau Paleng
Pulau Salue Besar
Pulau Salue Kecil
Pulau Timpaus
Kepulauan Togian
Pulau Bagian
Pulau Patudaka
Pulau Poat
Pulau Togian
Pulau Waleabahi
Pulau Jna Uma
Pulau Menui
Sulawesi Tenggara
Pulau Anano
Pulau Bahubulu
Pulau Bakealu
Pulau Batuala
Pulau Bawulu
Pulau Bokori
Pulau Buaya
Pulau Buton
Pulau Damalawa
Pulau Hari
Pulau Kabaena
Pulau Kadatua
Pulau Kaholifano
Pulau Karame
Pulau Kawi-Kawi
Pulau Labangke
Pulau Labasina Kecil
Pulau Langee
Pulau Lemo
Pulau Lentea
Pulau Lua Cempedak
Pulau Makassar
Pulau Manai
Pulau Maniang
Pulau Masaloka
Pulau Muna
Pulau Padamarang
Pulau Pisang
Pulau Runduma
Pulau Sagori
Pulau Saponda Barat
Pulau Saponda Laut
Pulau Siompu
Pulau Tambako
Pulau Telaga Besar
Pulau Telaga Kecil
Pulau Tobea Besar
Pulau Tobea Kecil
Kepulauan Tukang besi
Pulau Binongko
Pulau Hoga
Pulau Kaledupa
Pulau Kapota
Pulau Tomia
Pulau Wangi-Wangi (Wanci)
Pulau Runduma
Kepulauan Tiworo
Pulau Balu
Pulau Bero
Pulau Gola
Pulau Katela
Pulau Kayu Angin
Pulau Maginti
Pulau Maloang
Pulau Mandi
Pulau Rangku
Pulau Tabuang
Pulau Wakiwolu
Pulau Waitonga Selatan
Pulau Wowoni
Sulawesi Utara
Pulau Anda
Pulau Ariagai
Pulau Armadures
Pulau Batunderang
Pulau Bengdarat
Pulau Biaro
Pulau Bukide
Pulau Buang
Pulau Bunaken
Pulau Dalam
Pulau Dumarchen
Pulau Kabaruan
Pulau Kamalusu
Pulau Kabaruan
Pulau Karakelang
Pulau Kawio
Pulau Lembe
Pulau Lipang
Pulau Mamanuk
Pulau Manadotua
Pulau Mantehage
Pulau Miangas
Pulau Meares
Pulau Mekonane
Pulau Pahepa
Pulau Pasige
Pulau Ruang
Pulau Salibabu
Pulau Sangihe
Pulau Sangir
Pulau Siau
Pulau Tehang
Pulau Tahulandang
Pulau Talisei
Papua Barat
Pulau Adi
Pulau Aiduma
Kepulauan Ayu
Pulau Batanta
Pulau Daram
Pulau Fam
Pulau Gag
Pulau Gam
Pulau Karas
Pulau Kofiau
Kepulauan Mapia
Pulau Maswaar
Pulau Misol
Pulau Rumberpon
Pulau Sabuda
Pulau Salawati
Pulau Sayang
Pulau Semai
Pulau Waigeo
Pulau War
Pulau Wayang
Papua
Pulau Biak
Pulau Dolak (Yos Sudarso)
Pulau Komoran
Pulau Num (Miosnum)
Pulau Numfor
Pulau Room
Pulau Supiori
Pulau Wakde
Pulau Witau
Pulau Yamna
Pulau Yapen
Catatan :
Masih banyak lagi pulau di Indonesia baik yang sudah diberi nama dan dihuni maupun yang belum diberi nama dan belum dihuni oleh orang Indonesia sehingga kerapkali terjadi perebutan pulau antara Indonesia dengan negara-negara tetangga dengan tajuk persengketaan batas negara.
Jumlah pulau yang begitu banyak menyebabkan adanya nama pulau yang sama.
Pulau Ligitan kini milik Malaysia dan disahkan oleh International Court of Justice.
Pulau Sipadan kini milik Malaysia dan disahkan oleh International Court of Justice.
